Ciencia
Pliegue 3D del genoma identificado como capa molecular del Alzheimer
El estudio utilizó GAGE-seq, una técnica que mide simultáneamente expresión génica y contactos 3D del genoma en la misma célula individual, combinada con transcriptómica espacial para preservar la localización tisular. En células de la corteza prefrontal de donantes con Alzheimer, los compartimentos activos e inactivos del genoma mostraron límites menos definidos, lo que los autores llaman 'compartment mingling', junto con menor interacción entre genes y sus elementos reguladores cercanos. Estas alteraciones estructurales preceden o acompañan a la disfunción génica, lo que las posiciona como un componente del paisaje molecular de la enfermedad junto a las placas de amiloide y los ovillos de tau. La herramienta Hicformer permite explorar computacionalmente cómo cambios en el plegamiento alteran programas génicos, lo que la convierte en un recurso potencial para priorizar dianas terapéuticas.
Tu acción
Si trabajas con datos de Hi-C o ATAC-seq en modelos de enfermedad, descarga Hicformer y evalúa si puede integrarse en tu pipeline para predecir efectos de variantes reguladoras.